Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Snx10Q9CWT3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.5 ms