Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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