Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Olfr272-202ENSMUST00000107667 1936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ciao1Q99KN2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms