Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Kcnv1-201ENSMUST00000022967 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
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