Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Dnajc28Q8VCE1 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Dnajc28Q8VCE1 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dnajc28Q8VCE1 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dnajc28Q8VCE1 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Dnajc28Q8VCE1 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Dnajc28Q8VCE1 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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