Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Prdx6-202ENSMUST00000071718 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Usp27Q8CEG8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Usp27Q8CEG8 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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