Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Pramef8Q8CE24 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms