Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Dsg1bQ7TSF1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Dsg1bQ7TSF1 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms