Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trak1Q6PD31 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trak1Q6PD31 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms