Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm24279-201ENSMUST00000104236 131 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clcn1Q64347 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms