Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc18Q640L5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc18Q640L5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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Ccdc18Q640L5 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ccdc18Q640L5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc18Q640L5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ccdc18Q640L5 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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Ccdc18Q640L5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ccdc18Q640L5 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Ccdc18Q640L5 Fhl1-206ENSMUST00000116596 1203 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm23916-201ENSMUST00000158484 399 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 CT025547.1-201ENSMUST00000225127 578 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 AC161581.1-201ENSMUST00000228696 318 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Ccdc18Q640L5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm7823-201ENSMUST00000120761 1623 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Cog5-201ENSMUST00000036862 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm14853-201ENSMUST00000116081 549 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc18Q640L5 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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