Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rbm27Q5SFM8 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm27Q5SFM8 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms