Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm43895-201ENSMUST00000203219 855 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Lyrm1-209ENSMUST00000208424 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm6586-201ENSMUST00000167028 643 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Lrrc43Q3V0L5 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
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