Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Prnd-201ENSMUST00000110169 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Plut-202ENSMUST00000174285 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Puf60Q3UEB3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Isca2-206ENSMUST00000222449 374 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Puf60Q3UEB3 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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