Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm6517-201ENSMUST00000121056 511 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm17514-201ENSMUST00000181863 1102 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mir6934-201ENSMUST00000183965 62 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pik3r4-206ENSMUST00000188784 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gal-201ENSMUST00000025842 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Fcgr2b-204ENSMUST00000159969 1578 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Fcrl1-206ENSMUST00000194786 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Srsf6Q3TWW8 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms