Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 B230112G18Rik-201ENSMUST00000192979 851 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 B4galt4-203ENSMUST00000114710 837 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Scnm1-201ENSMUST00000172572 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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