Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Pate4Q09098 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms