Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
F13bQ07968 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms