Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tra2bP62996 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms