Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Opn1swP51491 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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