Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc13P50207 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms