Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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SrprbP47758 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SrprbP47758 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms