Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 M1ap-201ENSMUST00000113980 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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