Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Tcrg-V1-201ENSMUST00000103564 374 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ptk2P34152 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms