Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Adamtsl4-201ENSMUST00000015994 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd28P31041 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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