Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
CebpbP28033 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm23582-201ENSMUST00000158530 139 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm27444-201ENSMUST00000184157 137 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
CebpbP28033 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms