Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Prdm16-205ENSMUST00000105637 8595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Prdm16-201ENSMUST00000030902 8598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ggta1P23336 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Ggta1P23336 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ggta1P23336 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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