Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
TtrP07309 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TtrP07309 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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TtrP07309 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
TtrP07309 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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