Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprcP06800 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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PtprcP06800 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Gm18829-201ENSMUST00000188150 1622 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprcP06800 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms