Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
PdgfrbP05622 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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