Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Gm35239-201ENSMUST00000218346 487 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Gm5040-201ENSMUST00000218609 800 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Gm29689-201ENSMUST00000221076 589 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P01645 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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P01645 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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P01645 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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P01645 Rab11a-204ENSMUST00000167569 726 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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P01645 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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P01645 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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P01645 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Mettl18-202ENSMUST00000111490 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Dync2li1-201ENSMUST00000025101 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01645 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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