Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm38014-201ENSMUST00000193349 2612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Gm2056J3QQ02 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm15819-201ENSMUST00000153089 481 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm2056J3QQ02 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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