Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Gm42421F6X8D5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm42421F6X8D5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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