Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Prrt4B2RU40 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms