Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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Atp8b5A3FIN4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Atp8b5A3FIN4 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
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Atp8b5A3FIN4 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Atp8b5A3FIN4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms