Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
CcniQ9Z2V9 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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CcniQ9Z2V9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
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CcniQ9Z2V9 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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CcniQ9Z2V9 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
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CcniQ9Z2V9 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
CcniQ9Z2V9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms