Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm36948-201ENSMUST00000194708 3247 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm6141-201ENSMUST00000117181 695 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm19668-201ENSMUST00000178581 747 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43965-201ENSMUST00000203779 789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm44204-201ENSMUST00000204722 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 1810059H22Rik-207ENSMUST00000204809 289 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm2696-201ENSMUST00000220062 723 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 AC124555.1-201ENSMUST00000227051 880 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm8806-201ENSMUST00000120076 1407 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tph1-202ENSMUST00000107669 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm12796-201ENSMUST00000131864 344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 AC124772.3-201ENSMUST00000222535 575 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm22982-201ENSMUST00000082613 319 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Zc2hc1a-203ENSMUST00000193010 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm44547-201ENSMUST00000207793 1446 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r9a-206ENSMUST00000175962 3769 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Zscan5b-203ENSMUST00000165445 1407 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm12221-201ENSMUST00000125096 1131 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm13629-201ENSMUST00000141149 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 BC002189-201ENSMUST00000195674 598 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm31135-202ENSMUST00000208946 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Col5a3Q9JLI2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms