Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 F730311O21Rik-201ENSMUST00000189288 5447 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Olfr870-201ENSMUST00000086476 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Trim39Q9ESN2 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms