Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
MesdQ9ERE7 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
MesdQ9ERE7 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms