Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Smg9Q9DB90 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Smg9Q9DB90 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Smg9Q9DB90 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms