Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38001-201ENSMUST00000192900 3761 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 AW146154-201ENSMUST00000098509 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 AC165260.6-204ENSMUST00000225571 3508 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Prox2-201ENSMUST00000110249 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 4933427D06Rik-204ENSMUST00000168837 2467 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Rac2-201ENSMUST00000043214 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gtf3c6Q9D8P7 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 5430403N17Rik-201ENSMUST00000210717 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm232-201ENSMUST00000216549 2559 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15895-201ENSMUST00000157018 731 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6Q9D8P7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms