Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Clasp1-208ENSMUST00000187713 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Nop56Q9D6Z1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Nop56Q9D6Z1 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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