Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Use1Q9CQ56 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Use1Q9CQ56 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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