Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Rab7b-205ENSMUST00000136247 497 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pacsin3Q99JB8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pacsin3Q99JB8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms