Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Lyn-201ENSMUST00000041377 3463 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Apobec3Q99J72 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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