Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Fermt1-201ENSMUST00000038280 4915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 4930552P12Rik-201ENSMUST00000181198 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm28104-201ENSMUST00000188331 2168 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms