Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tnnc1-202ENSMUST00000169169 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm45719-201ENSMUST00000207954 1662 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rps6-201ENSMUST00000102814 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trappc12Q8K2L8 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm3791-201ENSMUST00000220790 768 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trappc12Q8K2L8 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trappc12Q8K2L8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trappc12Q8K2L8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trappc12Q8K2L8 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trappc12Q8K2L8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 AC131081.1-201ENSMUST00000219535 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trappc12Q8K2L8 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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