Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Pabpc5-202ENSMUST00000113366 2243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 8430423G03Rik-201ENSMUST00000110507 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Apoo-201ENSMUST00000113895 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Apoc2-203ENSMUST00000142352 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm28381-201ENSMUST00000188403 193 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 E330020D12Rik-203ENSMUST00000188717 766 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 4930515G16Rik-201ENSMUST00000199440 1256 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm45846-201ENSMUST00000211170 446 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Fam216b-202ENSMUST00000118785 1447 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Olfr543-202ENSMUST00000219647 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm12679-201ENSMUST00000123899 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm11608-202ENSMUST00000153049 877 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm6970-201ENSMUST00000169692 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm42952-204ENSMUST00000198572 408 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrit1Q8K099 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Rpain-202ENSMUST00000108529 282 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Xbp1-204ENSMUST00000149623 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Gm8174-201ENSMUST00000064353 1001 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrit1Q8K099 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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