Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3289-201ENSMUST00000200819 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44155-201ENSMUST00000203923 412 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Cdkl1Q8CEQ0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms