Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 1500004A13Rik-205ENSMUST00000184014 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ssuh2Q8C3L1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ssuh2Q8C3L1 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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